Alur pendaftaran Program Doktor:

1. Melakukan pendaftaran secara online di laman https://sister.unej.ac.id/pascasarjana mengisi Tanggal Lahir, NIK, nama lengkap, nomor whatsapp aktif, alamat email, jenis kelamin, pilihan strata, menyelesaikan hasil perhitungan. Kemudian tekan tombol daftar untuk mendapatkan akun yang berisikan informasi KAP dan PIN pada alamat email yang telah didaftarkan.
2. Login ke laman https://sister.unej.ac.id/pascasarjana dengan memasukkan KAP dan PIN yang telah didapat Mengisikan data personal, informasi pendidikan, informasi pekerjaan, mengunggah file pas foto 4×6 (ukuran file maksimum 100 kb, resolusi 400×600 dengan format file jpg) dan berkas persyaratan meliputi:
   a. Fotocopy ijazah S2 yang dilegalisir;
   b. Fotocopy transkrip S2 yang dilegalisir;
   c. Rekomendasi akademik;
   d. Surat keterangan kesehatan;
   e. Surat izin instansi bagi yang telah bekerja;
   f. Sertifikat TPA (skor minimal 500) yang dikeluarkan oleh Program Pascasarjana Universitas Jember atau BAPPENAS atau Perguruan Tinggi Negeri lain;
   g. Sertifikat TKBI (skor minimal 500) yang dikeluarkan oleh Program Pascasarjana Universitas Jember/ Pusat Bahasa Universitas Jember atau Pusat Bahasa Perguruan Tinggi Negeri atau Sertifikat TOEFL ITP (skor minimal 500) yang dikeluarkan oleh Lembaga yang diakui oleh The Indonesian International Education Foundation (IIEF);
   h. Bukti publikasi karya ilmiah di jurnal/prosiding (5 tahun terakhir) dan draf proposal penelitian terkait Disertasi.
   Setelah selesai mengunggah seluruh berkas persyaratan kemudian tekan tombol simpan dan lanjutkan serta kirim data.
3. Verifikasi dan validasi persyaratan administrasi pendaftaran.
4. Mencetak tagihan dan membayar biaya pendaftaran Program Pascasarjana Universitas Jember sebesar Rp. 750.000,- (tujuh ratus lima puluh ribu rupiah) untuk Program Studi Doktor (S3) ke bank yang bekerjasama dengan Universitas Jember.
5. Mencetak kartu peserta Penerimaan Mahasiswa Baru Program Pascasarjana Universitas Jember Tahun 2025.
6. Tes wawancara bagi Program Studi Ilmu Hukum, Ilmu Administrasi, Ilmu Ekonomi, Manajemen dan Bioteknologi.
7. Bagi peserta yang lulus tes wawancara, akan mendapatkan Letter of Acceptance (LoA) dari Program Pascasarjana Universitas Jember sebagai bukti diterima menjadi mahasiswa baru Universitas Jember.